Browsing by Author "LU HENRY HORNG-SHING"
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Item type:Item, 基因網路和表現型特徵間關聯之統計分析(2009) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所Item type:Item, 基因網路和表現型特徵間關聯之統計分析(2011) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所Item type:Item, 基因網路和表現型特徵間關聯之統計分析(2010) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所Item type:Item, 大型的酵母基因網路之統計分析(2008) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所我們是否可能針對大量和複雜的生物網路來發展簡化的模型以獲得深刻的暸解? 這是後基因體 時代中關於系統生物學的一項重大挑戰。我們計畫針對這項目的發展統計方法,並應用酵母菌方面的 大量基因網路作為研究課題。 首先,我們必須降低統計方法的計算複雜度以分析大量基因網路。 例如, 我們計畫改進降維法 以降低其計算的複雜度,這些方法包括多維尺度法以及相關的非線性的降維法。 這些改進的方法將 用於研究酵母菌的細胞週期及其生物網路分析。 其次,我們必須開發統計方法來研究基因表現曲線,以探討大量的基因網路。 通常基因表現曲 線可能有時間差,所以我們需要進行定位以進一步分群和分類。我們計畫發展統計方法來分析酵母菌 在發酵時雙生長期轉移過程中的基因表現曲線,接著應用布林和貝氏網路進行後續的網路分析。 最後,更具有挑戰性的研究課題是: 發展統計方法來分析大量基因網路中的交互作用模式。由於 交互作用模式的差異,不同實驗技術產生的資料型態將有所不同。因此,我們計畫發展統計方法來整 合不同實驗技術和實驗室的資料,以建立統計的誤差模型,進一步推論與分析酵母菌蛋白質交互作用 網路中的交互作用模式。 透過這個長期研究計畫,我們將發展改進的統計方法,降低其計算的複雜度,針對酵母菌的大量 基因網路,進行降維法研究,網路分析,與交互作用模式偵測。這些方法也可用來研究系統生物學中 人類和其他物種的大量基因網路。Item type:Item, 大型的酵母基因網路之統計分析(2007) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所我們是否可能針對大量和複雜的生物網路來發展簡化的模型以獲得深刻的暸解? 這是後基因體 時代中關於系統生物學的一項重大挑戰。我們計畫針對這項目的發展統計方法,並應用酵母菌方面的 大量基因網路作為研究課題。 首先,我們必須降低統計方法的計算複雜度以分析大量基因網路。 例如, 我們計畫改進降維法 以降低其計算的複雜度,這些方法包括多維尺度法以及相關的非線性的降維法。 這些改進的方法將 用於研究酵母菌的細胞週期及其生物網路分析。 其次,我們必須開發統計方法來研究基因表現曲線,以探討大量的基因網路。 通常基因表現曲 線可能有時間差,所以我們需要進行定位以進一步分群和分類。我們計畫發展統計方法來分析酵母菌 在發酵時雙生長期轉移過程中的基因表現曲線,接著應用布林和貝氏網路進行後續的網路分析。 最後,更具有挑戰性的研究課題是: 發展統計方法來分析大量基因網路中的交互作用模式。由於 交互作用模式的差異,不同實驗技術產生的資料型態將有所不同。因此,我們計畫發展統計方法來整 合不同實驗技術和實驗室的資料,以建立統計的誤差模型,進一步推論與分析酵母菌蛋白質交互作用 網路中的交互作用模式。 透過這個長期研究計畫,我們將發展改進的統計方法,降低其計算的複雜度,針對酵母菌的大量 基因網路,進行降維法研究,網路分析,與交互作用模式偵測。這些方法也可用來研究系統生物學中 人類和其他物種的大量基因網路。Item type:Item, 建立台灣地區鮑氏不動桿菌整合性分析平台---台灣地區鮑氏不動桿菌分離株之網路分析與比較基因體研究(子計畫二)( II )(2015) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所Item type:Item, 建立台灣地區鮑氏不動桿菌整合性分析平台-台灣地區鮑氏不動桿菌分離株之網路分析與比較基因體研究(子計畫二)( I )(2014) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所Item type:Item, 影像擷取與網路結構偵測之統計分析與對應關係(2013) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所影像擷取與網路結構偵測之統計分析與 對應關係 影像擷取是一種從影像之中擷取出多個影像物件且伴隨著偵測各物件在各像素上 通透率的程序。譜方法影像擷取(Spectral Matting)是其中一種技術,可以達到多層次影 像物件擷取。其最重要的貢獻是提出了影像到網路的轉換關係,因而影像擷取問題可 以轉為一個網路上分析問題。近年來網路吸引甚多研究注意並且應用在多個領域。群 落結構是網路的基本重要特性,偵測群落結構可以被分析成一個對模組度(modularity) 最大化的問題,此最佳化可進一步化成矩陣分析及譜分割問題。 因此,我們計畫研究影像擷取以及網路群落分析之間的關連性,使得能利用雙方的 好處發展出有效率高品質的影像擷取成果,影像擷取中估測物件通透率的問題,將能 對應到網路分析中的群落偵測問題,結合雙方領域的知識技術,我們期待能發展出比 現存更有效率、更高品質的影像擷取演算法。此外,透過網路群落分析,我們將能解 決譜方法影像擷取中最大的問題:決定多少個影像物件(matting component)。 另外,統計式區塊模型亦是一種分析網路群落的方式,採用統計推論的方式。此模 型的發展能達到重疊群落結構,然而現存文獻中,邊(edge)的假設並不符合影像擷取所 對應到的網路中邊該具備的特性,我們計畫發展適當的模型,並直接達到軟分割結果, 以解決影像擷取最重要的問題。Item type:Item, 影像擷取與網路結構偵測之統計分析與對應關係(2012) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所影像擷取與網路結構偵測之統計分析與 對應關係 影像擷取是一種從影像之中擷取出多個影像物件且伴隨著偵測各物件在各像素上 通透率的程序。譜方法影像擷取(Spectral Matting)是其中一種技術,可以達到多層次影 像物件擷取。其最重要的貢獻是提出了影像到網路的轉換關係,因而影像擷取問題可 以轉為一個網路上分析問題。近年來網路吸引甚多研究注意並且應用在多個領域。群 落結構是網路的基本重要特性,偵測群落結構可以被分析成一個對模組度(modularity) 最大化的問題,此最佳化可進一步化成矩陣分析及譜分割問題。 因此,我們計畫研究影像擷取以及網路群落分析之間的關連性,使得能利用雙方的 好處發展出有效率高品質的影像擷取成果,影像擷取中估測物件通透率的問題,將能 對應到網路分析中的群落偵測問題,結合雙方領域的知識技術,我們期待能發展出比 現存更有效率、更高品質的影像擷取演算法。此外,透過網路群落分析,我們將能解 決譜方法影像擷取中最大的問題:決定多少個影像物件(matting component)。 另外,統計式區塊模型亦是一種分析網路群落的方式,採用統計推論的方式。此模 型的發展能達到重疊群落結構,然而現存文獻中,邊(edge)的假設並不符合影像擷取所 對應到的網路中邊該具備的特性,我們計畫發展適當的模型,並直接達到軟分割結果, 以解決影像擷取最重要的問題。Item type:Item, 生物網路和調控路徑的統計分析(II)(2006) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所Item type:Item, 階層式網絡模型及其於高維度問題之應用(2014) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所Item type:Item, 階層式網絡模型及其於高維度問題之應用(2015) ;盧鴻興 ;LU HENRY HORNG-SHING國立交通大學統計學研究所