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2014人類3-巰基丙酮酸硫轉移酶其脫硫機制之 理論探討陳盈孝; Chen, Ying-Siao; 尤禎祥; Yu, Jen-Shiang; 生物科技系所
2009以結構生物資訊為基礎之蛋白質工程與設計平台---子計畫2---蛋白質結構重組之模擬與計算驗證系統(I)尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系(所)
2011以結構生物資訊為基礎之蛋白質工程與設計平台---子計畫2-蛋白質結構重組之模擬與計算驗證系統(III)尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2010以結構生物資訊為基礎之蛋白質工程與設計平台---子計畫二:蛋白質結構重組之模擬與計算驗證系統(II)尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2012內含蛋白媒介之蛋白質接合反應中氮-硫酰基重排反應機構理論及其圓二色光譜研究朱沛全; Chu, Pei-Chuan; 尤禎祥; 江素玉; Yu, Jen-Shiang; Chiang, Su-Yu; 工學院加速器光源科技與應用碩士學位學程
2011國立交通大學生物科技學系尤禎祥教師升等送審著作論文集尤禎祥
2008多碘離子與多醣錯合物之理論光譜模擬研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系(所)
2008多碘離子與多醣錯合物之理論光譜模擬研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系(所)
2012破缺對稱性密度泛函理論與對稱性調適叢集組態交互作用法應用於高活性生物分子之電子結構研究劉冠佑; Liu, Kuan-Yu; 尤禎祥; Yu, Jen-Shiang; 生物科技系所
2014過渡金屬錯合紫質環類與其衍生物之電子結構理論研究及應用尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2015過渡金屬錯合紫質環類與其衍生物之電子結構理論研究及應用尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2016過渡金屬錯合紫質環類與其衍生物之電子結構理論研究及應用尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2013過渡金屬離子與含硫蛋白質結合機制理論研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2010金屬配位巨分子之理論設計研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2009金屬配位巨分子之理論設計研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系(所)
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