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2016使用高通量定序測小RNA及mRNA降解率計算分析方法張家華; 洪瑞鴻; Chang, Chia-Hua; Hung, Jui-Hung; 生醫工程研究所
2015國立交通大學生物資訊及系統生物研究所洪瑞鴻教師升等送審著作論文集洪瑞鴻
2006基於人類與小鼠微陣列基因表現圖譜識別功能性基因群洪瑞鴻; 黃憲達; Hsien-Da Huang; 生物資訊及系統生物研究所
2016基於去氧核醣核酸與組蛋白之修飾特徵識別轉錄因子之功能戴璟淳; 洪瑞鴻; Tai, Ching-Chun; Hung, Jui-Hung; 生物資訊及系統生物研究所
2015基於次世代定序資料偵測小沉默核醣核酸上的非範本附尾修飾的高效排比器周旻德; Chou, Min-Te; 洪瑞鴻; Hung, Jui-Hung; 生物資訊及系統生物研究所
2013建構微小干擾核醣核酸之修短與附尾機制之雲端偵測平台洪瑞鴻; Hung Jui-Hung; 國立交通大學生物科技學系（所）
2015微小干擾核糖核酸與人類Argonaute蛋白質之類化分析李俊緯; Li, Joye; 洪瑞鴻; Hung, Jui-Hung; 生物資訊及系統生物研究所
2015微小干擾核醣核酸與人類Argonaute蛋白質之類化訊號及其修短與附尾機制之研究洪瑞鴻; Hung Jui-Hung; 國立交通大學生物科技學系（所）
2016微小干擾核醣核酸與人類Argonaute蛋白質之類化訊號及其修短與附尾機制之研究洪瑞鴻; Hung Jui-Hung; 國立交通大學生物科技學系（所）
2015應用主成分分析於老鼠胚胎幹細胞免疫沈澱定序資料揭示轉錄因子與組蛋白修飾標記在特定區域的顯著關係曾晴雯; Tseng, Chin-Wen; 洪瑞鴻; Hung, Jui-Hung; 生物資訊及系統生物研究所
16-九月-2008應用於低密度奇偶校驗解碼器之迴旋比較方法洪瑞徽; 洪瑞鴻; 陳紹基
11-八月-2010應用於低密度奇偶校驗解碼器之迴旋比較方法洪瑞徽; 洪瑞鴻; 陳紹基
1-十月-2008應用於低密度奇偶校驗（LDPC）解碼器之集合迴旋比較方法洪瑞徽; 洪瑞鴻; 陳紹基
11-八月-2010應用於低密度奇偶校驗（ＬＤＰＣ）解碼器之集合迴旋比較方法洪瑞徽; 洪瑞鴻; 陳紹基
2013次世代定序配接序列偵測演算法實作及其效能驗證翁瑞成; Weng, Jui-Cheng; 洪瑞鴻; Hung, Jui-Hung; 生物資訊及系統生物研究所
2017適用單端與雙端次世代定序之全自動智慧配接器偵測演算法謝汶甫; 洪瑞鴻; Hsieh, Wen-Fu; Hung, Jui-Hung; 生物資訊及系統生物研究所
2016開發基於K-means-pHMM 機器學習演算法之交聯免疫沈澱法高通量定序的泛用分析框架蕭瓊柏; 洪瑞鴻; Hsiao, Chiung-Po; Hung, Jui-Hung; 生物資訊及系統生物研究所
2014革新次世代定序雲端分析平台---使用雲端隨需自助服務與統一計算架構GPU運算洪瑞鴻; Hung Jui-Hung; 國立交通大學生物科技學系（所）
2015革新次世代定序雲端分析平台---使用雲端隨需自助服務與統一計算架構GPU運算洪瑞鴻; Hung Jui-Hung; 國立交通大學生物科技學系（所）
2015高度可平行化的長片段生物序列之FM-index變體李昀龍; Li, Yun-Lung; 洪瑞鴻; Hung, Jui-Hung; 生物資訊及系統生物研究所
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