Browsing by Author "CHEN JING-YING"

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Ontology 驅動之生物資訊探勘環境
(2004)
陳俊穎
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CHEN JING-YING
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國立交通大學資訊科學學系
隨著生物科技的蓬勃發展, 生物資訊技術的研究與發展益發重要。藉由不同資料庫搜尋及資訊探勘工具，生物學家期能發現生化方面有趣的現象及規律。然而隨著網路上生物資料庫及分析工具的大量累積，它們之間的異質性使得知識及資源的交流變的更困難。為了處理這個問題, 現代生物資訊系統的課題之一即為系統整合。另一方面, 由於生物領域本身的廣大及生命現象的複雜性, 系統整合僅能提升工具使用的方便性, 但生物資訊的基本需求, 即現象及規律的發現, 仍需生物學家不斷的試誤與經驗累積. 為了提供進一步的輔助工具, 我們計畫於一個分散式生物資訊整合系統上建立一個以 Ontology 為準則的資訊探勘環境. 藉由Ontology 的輔助, 生物學家能快速瞭解不同資料形式即類別, 及其與相關工具的關聯. 更重要的是, 系統設計者能藉Ontology 提供智慧型的探勘輔助, 加速.我們會在這環境下發展一些特殊生物資訊服務用以驗證我們的設計。例如, 我們將發展一個基因顯現(Gene Expression) 資料庫來支援相關且重要的生物晶片技術。我們深信這種環境完成後可大幅加速生化科技的研究速度。這點尤其對台灣未來生化科技領域的推動有很大的助益。
整合型生物資訊處理系統之建造
(2002)
陳俊穎
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CHEN JING-YING
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國立交通大學資訊科學學系
服務導向計算中可擴充之資源管理及排程系統之設計與實作
(2006)
陳俊穎
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CHEN JING-YING
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國立交通大學資訊工程學系(所)
格網計算及相關之同儕計算技術為當今重點發展之平行與分散式計算技術。最近格網計算的發展已與網際網路服務的發展方向趨於一致，而人們常以所謂服務導向計算來概括這些大量運用網際網路的分散式計算技術。服務導向計算與以往分散式計算不同的要點在於前者意圖將分散各地的運算及網路資源利用網際網路組成一個大型虛擬的超級電腦，而被整合的資源仍然保有其本身的資源配置及安全控管的權利。然而，在此種虛擬平台中，不同運算及網路資源的效能或頻寬具有極大變異，使得同一工作在此虛擬電腦的執行效能有極大落差。為了控制此種變異，有效的資源管理機制是相當重要的。現今雖有許多資源管理機制被提出且應用在不同系統，但由於它們多使用固定的決策機制或排程演算法，對資源效能變異極大的服務導向計算平台將無法有效地動態調整因應。我們計畫運用模擬的方法來幫助資源管理，並探討其可行性。由於這幾年我們已漸漸發展一個可用的服務導向計算平台，我們計畫在此平台上設計與實作一能執行平行程式的子系統，並發展不同的排程演算法。此系統的特點為同一平行程式可在真實或模擬的模式下執行，並且使用同一排程演算法程式。藉由蒐集及統計某平行程式過去的執行效能資料，並對不同排程演算法作模擬，系統可根據結果選用適當的排程及資源管理策略。為了瞭解此方法的可行性，我們計畫更改格網計算研究常用的Grid-NPB Benchmarks，使之在我們的服務導向計算平台上執行。我們將分析不同Grid-NPB 程式在不同排程演算法下的效能，以作為進一步研究的依據。