Ontology 驅動之生物資訊探勘環境

Abstract

隨著生物科技的蓬勃發展, 生物資訊技術的研究與發展益發重要。 藉由不同資料庫搜 尋及資訊探勘工具，生物學家期能發現生化方面有趣的現象及規律。 然而隨著網路上 生物資料庫及分析工具的大量累積，它們之間的異質性使得知識及資源的交流變的更困 難。為了處理這個問題, 現代生物資訊系統的課題之一即為系統整合。 另一方面, 由 於生物領域本身的廣大及生命現象的複雜性, 系統整合僅能提升工具使用的方便性, 但生物資訊的基本需求, 即現象及規律的發現, 仍需生物學家不斷的試誤與經驗累積. 為了提供進一步的輔助工具, 我們計畫於一個分散式生物資訊整合系統上建立一個以 Ontology 為準則的資訊探勘環境. 藉由Ontology 的輔助, 生物學家能快速瞭解不同資 料形式即類別, 及其與相關工具的關聯. 更重要的是, 系統設計者能藉Ontology 提供 智慧型的探勘輔助, 加速.我們會在這環境下發展一些特殊生物資訊服務用以驗證我們 的設計。例如, 我們將發展一個基因顯現(Gene Expression) 資料庫來支援相關且重要 的生物晶片技術。我們深信這種環境完成後可大幅加速生化科技的研究速度。這點尤其 對台灣未來生化科技領域的推動有很大的助益。