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2009以結構生物資訊為基礎之蛋白質工程與設計平台---子計畫2---蛋白質結構重組之模擬與計算驗證系統(I)尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系(所)
2011以結構生物資訊為基礎之蛋白質工程與設計平台---子計畫2-蛋白質結構重組之模擬與計算驗證系統(III)尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2010以結構生物資訊為基礎之蛋白質工程與設計平台---子計畫二:蛋白質結構重組之模擬與計算驗證系統(II)尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2008多碘離子與多醣錯合物之理論光譜模擬研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系(所)
2008多碘離子與多醣錯合物之理論光譜模擬研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系(所)
2014過渡金屬錯合紫質環類與其衍生物之電子結構理論研究及應用尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2015過渡金屬錯合紫質環類與其衍生物之電子結構理論研究及應用尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2016過渡金屬錯合紫質環類與其衍生物之電子結構理論研究及應用尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2013過渡金屬離子與含硫蛋白質結合機制理論研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2010金屬配位巨分子之理論設計研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系（所）
2009金屬配位巨分子之理論設計研究尤禎祥; Yu Jen-Shiang K.; 國立交通大學生物科技學系(所)
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