蛋白質中胺基酸的自由空間與序列保留度的關係

標題:	蛋白質中胺基酸的自由空間與序列保留度的關係 The relationship between the free space and the conservation of residues in a protein
作者:	鄭智文 Cheng, Chih-Wen 黃鎮剛 Hwang, Jenn-Kang 生物資訊及系統生物研究所
關鍵字:	自由空間;序列保留度;蛋白質結構;Free space;Sequence conservation;Protein structure
公開日期:	2015
摘要:	蛋白質序列中序列保留性高的氨基酸常常在功能上或結構上是重要的. 每個氨基酸在序列保留的程度上通常會受到它們的本身的物理性質所影響. 其中一個性質是緊湊的蛋白質結構中的自由空間. 在這次的研究中, 我們提出一個基於Voronoi體積的方法來量化氨基酸周圍的自由空間, 名叫Relative Space of Voronoi (RSV). 根據計算序列保留度和結構特性的相關係數, 結果顯示沿著序列上的氨基酸其序列保留度上的變化和RSV有很好的相關性. 我們的結果提出另一種方式來研究序列保留度和結構特性之間的關係. 蛋白質序列中序列保留性高的氨基酸常常在功能上或結構上是重要的. 每個氨基酸在序列保留的程度上通常會受到它們的本身的物理性質所影響. 其中一個性質是緊湊的蛋白質結構中的自由空間. 在這次的研究中, 我們提出一個基於Voronoi體積的方法來量化氨基酸周圍的自由空間, 名叫Relative Space of Voronoi (RSV). 根據計算序列保留度和結構特性的相關係數, 結果顯示沿著序列上的氨基酸其序列保留度上的變化和RSV有很好的相關性. 我們的結果提出另一種方式來研究序列保留度和結構特性之間的關係.
URI:	http://140.113.39.130/cdrfb3/record/nctu/#GT070257207 http://hdl.handle.net/11536/126782
Appears in Collections:	Thesis