應用電腦程式分析胜鈦之聯結歸掃描式質譜以輔助判斷其一級結構

Abstract

氨基酸單體在質譜儀中有其特徵斷裂離子碎片，可以當做判斷的基準，以決定其一級 結構，而使用電腦程式有助於輔助判斷。本研究發展出幾個電腦輔助判斷程式，主要 是參考Biemann 等人所用的方法。此外由於從聯結掃描式質譜所得到的訊號，在低分 子量區常發生離子斷裂不甚明顯的情形，造成辨識上的困難，所以對於計算中的第一 個氨基酸單體，採用雙氨基酸單體判斷(Double Amino Acid Residuals) 的方法，以 提高其判斷的準確性。而對於質譜訊號的擷取，也捨棄Biemann 的取臨界值百分比的 方法，而採用數據點百分比（擷取較強烈的質譜斷裂訊號），作為辨識氨基酸殘基的 種類，進而計算出胜鈦分子之氨基酸序列。 各胜鈦的質譜訊號經由計算，會得到成績（與質譜本身訊號之相似度）最好的20組氨 基酸序列，以作為判斷之參考。但由於胜鈦質譜的相似程度相當高，加上樣品本身的 質譜斷裂訊號，有時並非十分明顯，所以本程式尚無法完全正確地分析本實驗室所有 的胜鈦質譜，但對於訊號的前處理，已經有了明顯的改進，所以此程式有很大的潛力 。本實驗室繼續致力於改善數據的處理方法，並修正程式對氨基酸序列與質譜訊號相 似度的判斷，以期證明此一新方法的可行性及實用性。