平行反折板上殘基對的相關性突變對平行反折板的貢獻

Abstract

過去的研究顯示相關性突變可能可以提供長距離交互作用方面有用的相關資訊。雖然已有研究成果顯示相關性突變可以提供有用的資訊來輔助蛋白質結構/功能預測，但是近來也有研究暗示相關性突變並不是維持蛋白質結構穩定的主要要素。我們認為目前的相關性突變指標不夠精確，因而低估了相關性突變對維持蛋白質結構穩定的貢獻。所以我們試著定義出更能準確衡量出相關性突變的相關性突變測量方法。另一方面，平行反折板內的殘基對可以依側鏈相臨與否分為“氫鍵結配對”(HB) 和“非氫鍵結配對”(NHB) 兩種。前人的研究中說明以傳統的相關性突變指標所測量出 HB 和 NHB 間相關性突變的差異並不顯著，但是以我們的相關性突變指標可以指出 HB 和 NHB 在相關性突變上具有統計上的顯著差異，這個結果支持我們所設計的相關性突變指標相較於傳統的指標能更精確的測量出相關性突變。