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2009以生物資訊最佳化方法發展電腦輔助疫苗設計系統何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系(所)
2008以生物資訊最佳化方法發展電腦輔助疫苗設計系統何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系(所)
2007以生物資訊最佳化方法發展電腦輔助疫苗設計系統何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系(所)
2004以通適性三維人體參數模型為基礎之自動運動追蹤系統(III)何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系
2013應用雲端計算技術之老年醫學健康服務系統---醫學資料之因子分析與建模並應用於老年醫學健康照護系統的疾病預防 (GGHCS- FAMM)何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
2008生物系統內分子交互作用及生化路徑之大規模分析---(子計畫二):智慧型最佳化方法用於基因網路的重建與分析(I)何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系(所)
2009生物系統內分子交互作用及生化路徑之大規模分析---(子計畫二)智慧型最佳化方法用於基因網路的重建與分析(II)何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系(所)
2010生物系統內分子交互作用及生化路徑之大規模分析---子計畫二:智慧型最佳化方法用於基因網路的重建與分析(III)何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
2011研發人體免疫缺失病毒治療的最佳化藥物配方篩選系統何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
2003研發可繼承式的多目標演算法應用於異質性隨選視訊系統之最佳化設計何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系(所)
2010研發適用於公司營收預測系統的智慧型數學建模方法何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
2011運用系統生物學方法研究sRNAs在大腸桿菌的網路調控功能---研發雙目標建模的最佳化方法來重建、分析與驗證sRNAs基因調控網路(子計畫3)(I)何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
2012運用系統生物學方法研究sRNAs在大腸桿菌的網路調控功能---研發雙目標建模的最佳化方法來重建、分析與驗證sRNAs基因調控網路(子計畫3)(II)何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
2013運用系統生物學方法研究sRNAs在大腸桿菌的網路調控功能---研發雙目標建模的最佳化方法來重建、分析與驗證sRNAs基因調控網路(子計畫3)(III)何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
2014運用結合位資訊預測與生物實驗驗證CRP轉錄因子在大腸桿菌中的調控模式何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
2015運用計算與系統生物學方法重建葡萄糖對胰臟 beta 細胞之量化基因調控網路---建立基因調控網路數學模型以預測與分析胰臟 beta 細胞於高濃度葡萄糖作用(子計畫三)( I )何信瑩; Ho Shinn-Ying; 國立交通大學生物科技學系（所）
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